《表2 不同样品分离细菌数目及多样性》
5份土壤样品中共分离得到144株可培养细菌,对分离菌株16S rRNA基因进行PCR扩增、测序和序列比对,发现这些菌株来自5个门,分布在30个属52个种(表2)。如图1显示,最多的是变形菌门56株,达到总分离株的38.9%;其次是放线菌门49株,占比34.0%;厚壁菌门32株,占总数的22.2%;异常球菌-栖热菌门5株,占总数的3.5%;拟杆菌门最少,仅有2株,占总数的1.4%。将16S rRNA基因测序结果在EzTaxon数据库中比对获得参考序列,应用MEGA 6.0软件绘制系统发育树,得到进化树如图2所示。从系统发育分析的结果可以看出,放线菌门中最多的是链霉菌属(Streptomyces)14株,其次是节杆菌属(Arthrobacter)7株,最少的类谷氨酸杆菌属(Paeniglutamicibacter)、库克菌属(Kocuria)和韩国生工属(Kribbella)各1株。变形菌门中分别有α、β和γ三个亚门,α变形菌亚门最多的是Aureimonas,有7株;β变形菌类只有贪噬菌属(Variovorax);γ变形菌亚门中最多的是嗜冷杆菌属(Psychrobacter)(22株),其次是假单胞菌属(Pseudomonas)(15株)。对144株菌株测序时发现,有2株菌(1株属于变形菌门,1株属于放线菌门)的16S rRNA基因序列相似度均小于97%,可以认为是潜在新种[21]。这两株潜在新种的菌株鉴定工作正在进行中。
图表编号 | XD00174024200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 张雨欣、罗玮、俞勇、曾胤新、赵文玉、李会荣 |
绘制单位 | 大理大学药学与化学学院、自然资源部中国极地研究中心、自然资源部中国极地研究中心、自然资源部中国极地研究中心、自然资源部中国极地研究中心、长沙理工大学化学与食品工程学院、自然资源部中国极地研究中心 |
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