《表1 S.psychrophila WP2中基因组岛的基本信息》

《表1 S.psychrophila WP2中基因组岛的基本信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《深海嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2的基因组学分析》


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WP2的基因组比WP3的基因组大了约1 Mb,同时也是其他Shewanella菌中最大的,且WP2中包含有1 872个特异于WP3的基因(图5),推测这其中部分基因可能是来自水平转移来的基因组岛。因此,使用细菌基因组岛鉴定工具IslandViewer 4进行分析,发现在WP2中共有17个基因组岛,其GC含量均低于基因组平均GC含量(44.3%),且每个基因组岛上都含有转座酶和/或整合酶。它们的大小在4.3~35.3 kb之间,分别被命名为WP2GI1~WP2GI17(表1)。