《表1 不同时期‘夏黑’冬芽EB1和EB2测序》

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《植物信号转导对‘夏黑’葡萄冬芽休眠解除的调控》

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在葡萄冬芽处于生态休眠阶段时，单芽扦插于温室内，提取扦插7 d（EB1）和14 d（EB2）的葡萄冬芽总RNA，经检测满足测序质量需求，使用Illumina HiSeqTM4000平台进行测序（表1）。样本EB1和EB2均得到45 Mb以上的Clean Reads，其中质量大于20的碱基数目占总碱基数目的比例分别占总数的97%以上，质量大于30的碱基数目占总数的比例均在93%以上，使用HISAT软件将测序后经过滤得到的Clean reads比对到葡萄参考基因组序列（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Vi tis＿vinifera），Unique ly Mapping的比对率达到70%以上，说明测序质量满足后续组装要求。经拼接组装两样本得到的转录本数量均达到31 000以上，这些转录本与葡萄基因组比对，其中已知转录本为25 227个和25 030个，未知转录本数量为6 700左右。