《表5 熟制鲐鱼腐败细菌16S rDNA基因序列相似性分析》

《表5 熟制鲐鱼腐败细菌16S rDNA基因序列相似性分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《轻微加工熟制鲐鱼品质特性及腐败菌鉴定》


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采用16S r DNA测序法对6株菌进一步进行分子鉴定,将细菌测序所得的16S r DNA序列校对后,与N C B I的GenBank数据库进行B L A S T分析(表5),并构建系统发育树(图1),根据同源性远近进一步判定细菌种类。据亲缘性对比分析可知,A和B分别与Bacillus licheniformis(KY497446.1)和Bacillus subtilis(MF616407.1)具有100%的相似指数,C、D、E和F分别与Bacillus sonorensis(KF879303.1)、Brevibacterium sp.(AB066340.1)、Brevibacterium sp.(EU442367.1)和Brevibacterium sp.(KT580594.1)具有99%的相似指数。其中A、B和C测序结果与微生物鉴定结果一致,分别为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)和索诺拉沙漠芽孢杆菌(Bacillus sonorensis),D、E和F经过基因测序,均为短杆菌(Brevibacterium sp.),短杆菌没有表型或化学分类的特征,需用核酸技术完成其相应鉴定。