《表1 荧光定量PCR引物序列》

《表1 荧光定量PCR引物序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《环境雌激素双酚A暴露干扰仔鼠卵巢发育的研究》


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β-肌动蛋白:内参基因

使用小鼠双酚A检测试剂盒(上海润裕生物科技有限公司,Lot No,RY-12919),按照说明书操作,检测子代雌鼠血清及卵巢匀浆BPA含量。经4%多聚甲醛固定卵巢组织,进行石蜡切片,将切片分为3部分,一部分切片进行苏木素-伊红染色(hematoxylin-eosin staining,HE)染色,观察不同剂量BPA对卵巢组织的病理损伤情况;一部分切片用于免疫组织化学检测ERα和ERβ表达变化(一抗为兔抗鼠ERα单克隆抗体ab3575(Abcam公司,美国);兔抗鼠ERβ单克隆抗体ab3576(Abcam公司,美国);二抗为羊抗兔多克隆抗体SV0001(博士德生物技术有限公司,北京));一部分切片使用原位末端转移酶标记技术(terminal deoxynucleotidyl transferasemediated dUTP-biotin nick end labeling assay,TU-NEL)法检测细胞凋亡(TUNEL细胞凋亡检测试剂盒11684817910(Roche,美国))。液氮保存的卵巢组织,提取总RNA进行转录组测序和荧光定量PCR检测。总RNA提取和反转录试剂盒购自普洛麦格(Promega,美国)。转录组测序委托北京诺禾致源生物信息科技有限公司,使用Illumina测序平台Illumina HiSeq对空白对照组和50 mg/kg组卵巢进行转录组测序。测序结果经比对得到差异基因后将差异基因导入基因本体(Gene Ontology,GO)数据库和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库进行注释分析。差异基因功能按照生物进程、细胞组分和分子功能3个基因功能分类。根据基因功能的包含关系,将富集的基因功能绘制有向无环图(directed acyclic graph,DAG),DAG图为差异基因GO富集分析结果的图形化展示方式,分支代表包含关系,从上至下所定义的功能范围越来越小,DAG图可以将相似功能基因集合,并通过从属关系得到最准确的功能注释。对测序所得差异基因进行荧光定量PCR验证,荧光定量PCR采用两步法,PCR反应体系(20μL):Roche FastStart Universal SYBR Green Master,10μL;ddH2O,6μL;10μmol/L上、下游引物各1.5μL;cDNA样品1μL(cDNA浓度5ng/μL;引物浓度0.1μmol/mL;引物列于表1扩增程序为:95℃600 s;95℃30 s,60℃10 s,45个循环。熔解曲线程序为:95℃10 s,65℃60 s然后以0.2℃/s的速度升温至97℃,最后37℃30 s冷却。引物序列由大连宝生物公司设计\\合成,引物序列见表1。