《表4 发酵样品样品多样性指数》

《表4 发酵样品样品多样性指数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《开菲尔粒发酵过程酵母菌多样性和动态规律》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

多样性指数用于研究环境中微生物的多样性,Shannon指数和Simpson指数综合衡量物种的多样性,Shannon指数数值越高,Simpson指数越低说明物种多样性更丰富。样品AJ000X的Shannon指数为0.0059,Simpson指数为4.4516。说明样品中酵母菌OTU多样性很低,这些样品在刚发酵时活化时间为24 h,活化前可能存放时间较长,或者因为太干凝固导致样品真菌多样性较低。在发酵24 h后,样品中酵母菌进一步活化,24 h Shannon指数为0.9493,Simpson指数为0.1612,表明酵母菌多样性开始增加。原因是其他类型的酵母菌开始繁殖。Chao1指数和ACE指数主要用于衡量样本中的物种种类丰富度。Chao1指数主要利用只含有1条序列的OTU数目(singleton)和只含有2条序列的OTU数目(doubleton)来判断群落的物种丰富度,它对单个物种的变化更为敏感,它的数值越大,表示物种种类越多;ACE指数是通过singleton和稀有物种(出现≤10次)来估算还有多少没被发现的物种,当测序中singleton的比例越大,ACE值越大,样本的真实物种种类越多。样品0 h的Chao1指数和ACE指数均最高,表明这个样品中酵母菌OTU种类较多;而样品24 h、48 h、72 h的Chao1指数降低,ACE指数也随着降低,表明样品中酵母菌OTU种类慢慢变少。酵母菌数目在72 h最低,随着发酵时间的增大,酵母菌的数目从24 h后一直在减少。说明在发酵的前期有大量的酵母菌分解乳糖,为乳酸菌的发酵提供能量和材料。在发酵的后期,酵母菌菌落数目减少。Simpson指数值很低,说明群落多样性越低,Shannon值越来越小,说明群落多样性变低。