《表1 各组学数据库:面向工业生物技术的系统生物学》

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《面向工业生物技术的系统生物学》


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比较转录组学通过对不同条件下基因表达水平的比对分析,来研究不同条件下的响应变化与不同菌株之间的差异。时间序列转录组数据可以动态地再现细胞内基因的表达变化,变化趋势一致的基因可能会有比较一致的功能。时间序列的转录组数据可展示不同生命过程中基因的动态变化,这些变化信息蕴含着丰富的调控关系,有助于我们更加深刻地认识微生物内部基因的动态关系,理解代谢过程。转录组数据库收集了不同物种不同条件下的转录组数据,如GEO[11]、ArrayExpress[12]与M3D[13]等为转录组的整合分析提供了宝贵的数据资源(表1)。