重症手足口病是手足口病患儿死亡的重要原因，而EV71与中枢神经系统严重的并发症密切相关。该课题通过对重症手足口病患者EV71 VP1基因进行测序，分析浙江省2012-2014年手足口病(重症)患儿EV71 VP1基因的流行特征及该地区EV71的基因型及基因亚型；同时分析该地区EV71 VP1蛋白的氨基酸序列与各基因型代表株的突变位点；观察EV71病毒载量与疾病严重度的关系；同时收集手足口病患儿的大便标本进行EV71病毒核酸检测，并对EV71病毒核酸阳性的手足口病患儿的肠道排毒情况进行追踪和随访；比较普通型手足口病患儿及重症手足口病患儿的肠道排毒时间的差异。

研究结果：1.该地区肠道病毒71型感染的重症手足口病的VP1基因型为C4a亚型，并未发现其他基因亚型。2.在C4进化分支中，15株EV71处在不同的簇中，揭示本地EV71的流行存在多个传播链。3.该研究结果中发现EV71有11个主要氨基酸突变位点，为以后观察EV71相关神经毒性毒力位点提供一定的参考依据。4.绝大多数分离株在VP1基因22位点的谷氨酰胺转变为组氨酸(Q→H)，而这一位点的突变有可能与2008年的手足口病暴发流行或引起重症手足口病有关。5.EV71病毒载量与病情严重程度无关；6.手足口病患儿大便中病毒存在较长的时间，EV71持续最长时间为10周；7.感染EV71的手足口病患儿的肠道排毒持续时间与病情轻重相关，重症EV71感染手足口病患儿的肠道排毒时间更长。

应用推广及效益情况：该项目为监测EV71引起的暴发流行株是本土还是输入提供了实验室依据，也为EV71疫苗的研制提供科学依据；该研究中的EV71分离株在氨基酸297个位点中主要突变位点有11个，为以后观察EV71相关神经毒性毒力位点提供一定的参考依据，也为监测EV71 VP1基因突变及基因突变所引起临床症状的改变提供参考依据，有利于手足口病的疾病监测及防控。该研究为手足口病防控和隔离期的制定提供了重要的依据，有利于减少手足口病病毒的传播，有利于减少手足口病患儿的交叉感染，并为手足口病患儿病愈后复学提供依据。

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