该项目属于农业领域，涉及到植物新品种的创制及应用。

莲是中国重要的水生经济植物，根据农业用途分为花莲、子莲和藕莲。其中花莲以花色和花型等观赏性状丰富多变，而深受大众喜爱，是中国十大传统名花之一。但因其于酷热盛夏(6-8月)开花，错过春秋旅游旺季，严重影响莲旅游产业的持续发展。因此，改良莲的花期性状，创制出整体花期延长至秋季的新品种(花期6-10月)，可满足民众秋季赏荷的需求，经济社会效益巨大。该项目开展了花莲种质资源评价、观赏性状的分子机制研究、新品种创制，最终选育了花期延长至秋季的秋荷系列新品种，并构建了莲高效育种技术体系。主要研究内容如下：

1、收集和评价了世界范围的花莲种质资源，获得了观赏性状优异的花莲种质。在莲全球分布地(中国、日本、泰国、印度、印度尼西亚、澳大利亚、美国、加拿大)收集了花莲品种和野生资源970份；调查了花莲种质花色、瓣型、花期等观赏性状，完成了AFLP、SSR和SRAP分子标记鉴定，首次绘制了花莲DNA指纹图谱，构建了涵盖花莲90％遗传多态性的核心种质库。

2、基于莲基因组学和观赏性状的分子机理研究，开发了用于花莲分子育种的功能标记。完成了千年古莲'中国古代莲'的基因组测序和注释，绘制了世界上首张莲基因组参考图谱，构建了第一张莲遗传连锁图，建立了莲基因组数据库；率先开展了花色、瓣型、花期(地下茎发育)的关联分析和比较转录组学研究，鉴定了各性状关联的候选基因，开发了观赏性状的特异功能标记。

3、莲高效育种技术体系的建立和长花期秋荷系列品种的选育。利用观赏性状的功能标记，建立了“杂交育种-分子育种”的莲高效育种技术体系。通过将重要花莲种质美洲黄莲和热带莲的黄花、长花期等优异性状基因导入温带莲，创制了一系列花色花型新颖、花期延长的莲新种质材料，其中在长江中下游及其以南地区花期可持续至10月下旬的秋荷系列新品种9个，突破了只能夏季赏荷的季节限制，实现了秋季赏荷的目标。

项目实施期间，共获得国家发明专利3项，审定省级品种1个，国际登录荷花新品种9个，发表学术论文18篇、专著1部。秋荷系列新品种及其配套栽培技术在湖北、江西、江苏、安徽等省累计推广面积2260亩，新增利润4000万元。该项目所培育秋荷极大地延长了莲的观赏期，突破了夏季赏荷的季节限制，促进了花莲旅游业的持续发展，对花莲品种升级和产业转型具有重大的意义。

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