《HIV-1流行重组型和基因亚型空间演化趋势的动态研究》

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该研究应用地理信息技术(geographic information system, GIS)和方法分析该区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)流行重组型CRF01_AE、CRF08_BC、CRF07_BC和基因亚型B、G、C在时间、空间上的分布,动态观察HIV-1各流行重组型和基因亚型时空分布形成、发展和演变的过程,研究人口流动、交通环境等社会地理因素在HIV-1各亚型和流行重组型时空分布趋势上的作用,建立HIV-1各亚型和流行重组型时空数据库,评估其时空分布趋势,绘制时空分布趋势模拟图,提供HIV-1各亚型及重组毒株的时空流行趋势的数据,为该区针对性的制定HIV防治政策提供科学依据。收集现存活HIV阳性病人的抗凝全血,进行HIV-1亚型分析测定,建立样本数据库。建立了广西壮族自治区传染病示范区HIV/AIDS生物样本库,收集HIV/AIDS阳性血液样本2000余份,阴性观察队列血样40000余份。采集静脉血4ml,做好标记,送实验室用ElISA试剂做HIV检测复核,同时做HCV检测,登记检测结果,并将全血标本离心后分装1管血块(白细胞富集液)及3管血清(血浆),分别贴上项目四联不干胶标签,冷冻保存,转送至自治区疾控中心十二五生物样本库保存。课题组对所有的2000余份阳性样本进行了HIV-1亚型分析,测序结果表明,广西3个示范区主要流行的HIV-1亚型为CRF01-AE;收集新报告HIV/AIDS病例中的275份血样,用RT-PCR方法对HIV-1的prot-p51 RT和env C2-C4基因区域进行检测,系统进化和重组分析方法用于HIV-1亚型的确定。结果表明,课题组对HIV-1亚型进行基因系统进化分析后发现,不同年龄段人群的成簇比例由较为明显的差异,40岁以上的HIV/AIDS活跃簇比例在有逐步上升的趋势,HIV传播簇相对集中切传播路径较为活跃,HIV-1在中老年人群和离婚丧偶人群传播较为活跃。建立了示范区现存活HIV阳性者信息数据库,建立了生物样本库,在ACCESS基础上初步完成了生物样本数据库的建立。构建广西HIV-1亚型和CRF时空趋势模型:利用时空分析技术,在相关时空数据库基础上建立HIV-1趋势模型;绘制了3个示范区HIV分布地图,绘制了3个示范区HIV流行IDW差值地图,发现了示范区HIV高风险区域。使用ARGGIS9.2建立了示范区HIV/AIDS空间热点分析模型、IDW差值模型、空间自回归模型,在不同尺度空间分析HIV-1的空间流行模式。同时课题组还使用SPSS建立了ARIMA时间序列预测模型,研究HIV-1的时间趋势,正在将ARIMA模型和IDW差值模型进行整合,但因HIV检测工作具有较强的周期性,因为课题组拟采用进化树手段对HIV/AIDS进行分析以初步判断感染事件,相关工作依托“十二五”项目仍在开展中;根据HIV-1趋势模型,绘制广西HIV-1亚型和CRF时空分布趋势图,在大尺度空间上,根据HIV-1趋势模型,绘制处广西HIV-1亚型和CRF时空分布趋势图,提示这些热点地区存在导致当地艾滋病传播的高危传染源,为制定广西艾滋病防治措施提供了科学依据。项目注重成果转化,已发表科技论文15篇,其中核心期刊9篇。培养硕士研究生2人。

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