《表2 mPPO的二级结构预测》

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《膜结合态多酚氧化酶生物学信息分析》


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GOR算法是单序列预测方法中的一种,这种方法以信息论为基础,属于统计学方法的一种,而且是所有统计算法中理论基础最好的。GOR方法同时考虑被预测位置本身氨基酸残基种类对该位置构象的影响及相邻残基种类对该位置构象的影响两个方面,物理意义清楚明确,数学表达严格,预测的成功率提高到70%左右[17]。富士苹果中m PPO二级结构各构象组成比例如表2所示。结果表明,m PPO二级结构中的α-螺旋为18.67%,而β-折叠结构含量为23.33%,剩余的无规卷曲则为58.00%。预测的结果中,m PPO蛋白不含310螺旋、Pi螺旋、β-桥、β-转角、弯曲结构,以及其他结构。