《表2 有关ARHOs的数据库》
目前针对ARHOs的特异性数据库只有2个.2009年Arora等[12]发表了第一个加氧酶数据库Ox DBase,涵盖当时已发现的具有生物降解有机物功能的加氧酶,共包含235个单、双加氧酶,并又进一步划分为芳环羟化酶和环裂解酶.该数据库建立时间早,但是更新缓慢,目前也只有240余个加氧酶数据.第二个数据库为2014年Chakraborty等[21]发表了针对生物降解和生物催化过程中的细菌ARHOs数据库RHObase,共计约1000个记录,包含196个加氧酶α亚基、153个加氧酶β亚基、92个铁氧化还原蛋白、110个还原酶及131个细菌种的318个加氧反应.对于每一个蛋白序列均可以搜索其结构和保守域,还能预测输入的序列是否属于加氧酶.除此之外,还有一些包含了ARHOs的基因或蛋白序列的综合性数据库如表2所示.
图表编号 | XD0098210300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.20 |
作者 | 厉舒祯、邓晔、张照婧、曲媛媛 |
绘制单位 | 大连理工大学环境学院工业生态与环境工程教育部重点实验室、中国科学院生态环境研究中心中国科学院环境生物技术重点实验室、中国科学院生态环境研究中心中国科学院环境生物技术重点实验室、中国科学院大学资源与环境学院、大连理工大学环境学院工业生态与环境工程教育部重点实验室、中国科学院生态环境研究中心中国科学院环境生物技术重点实验室、大连理工大学环境学院工业生态与环境工程教育部重点实验室 |
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