《表2 有关ARHOs的数据库》

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《生物降解芳香族化合物的分子检测技术研究进展》


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目前针对ARHOs的特异性数据库只有2个.2009年Arora等[12]发表了第一个加氧酶数据库Ox DBase,涵盖当时已发现的具有生物降解有机物功能的加氧酶,共包含235个单、双加氧酶,并又进一步划分为芳环羟化酶和环裂解酶.该数据库建立时间早,但是更新缓慢,目前也只有240余个加氧酶数据.第二个数据库为2014年Chakraborty等[21]发表了针对生物降解和生物催化过程中的细菌ARHOs数据库RHObase,共计约1000个记录,包含196个加氧酶α亚基、153个加氧酶β亚基、92个铁氧化还原蛋白、110个还原酶及131个细菌种的318个加氧反应.对于每一个蛋白序列均可以搜索其结构和保守域,还能预测输入的序列是否属于加氧酶.除此之外,还有一些包含了ARHOs的基因或蛋白序列的综合性数据库如表2所示.