《表2 不同土壤样品中Alpha多样性指数》
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《基于MiSeq测序分析酸性农作物土壤细菌群落结构与多样性》
根据97%的相似度,将有效序列聚类为用于物种分类的OTU.经统计,6种农作物土壤样品中总细菌共有4 008个OTU,而其中可培养细菌共有97个OTU,且平均测序读长分别为438和449 bp.土壤总细菌的Chao 1丰富度指数和Shannon-Wiener多样性指数均明显(P<0.05)高于可培养细菌(见表2).由此表明,土壤中可培养细菌种类在土壤总细菌中的占比不足1%.此外,土壤总细菌的OTU数量、Chao 1丰富度指数和Shannon-Wiener多样性指数在这6种农作物土壤之间存在显著差异(P<0.05),表明6种农作物土壤中细菌的丰度和多样性存在差异,需要进一步探究决定这种差异的理化因子.对于6种农作物土壤中可培养细菌而言,驯化后OTU数量、Chao 1丰富度指数和Shannon-Wiener多样性指数之间差异不显著(P>0.05),表明外加的培养物极大地改变了细菌的群落结构,使彼此间差异不明显.此外,土壤总细菌和可培养细菌的Good's Coverage测序深度指数均高于99.6%,表明这些土壤样品中绝大部分的细菌被成功测序.
图表编号 | XD0089178700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.01 |
作者 | 王怡、常彬河、刘月、梁建军、薛芷筠、张泽文、何冬兰 |
绘制单位 | 中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心、中南民族大学湖北省微生物资源与利用工程技术研究中心 |
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