《表2 生物信息学在线程序及网址》
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《基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析》
将测序后得到的序列通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)中的Blast对比同源序列,然后借助蛋白结构和功能预测工具对KcSQS编码蛋白的理化性质(ProtParam)、信号肽(SignalP 5.0 Server)、亚细胞定位(CELLO v.2.5)、跨膜结构(TMHMM Server v.2.0)、蛋白结构(PSIPRED,SWISS-MODEL)等进行综合生物信息学分析。氨基酸序列比对利用NCBI的蛋白质序列数据库进行,再通过MEGAX构建Neighbor-joining系统进化树(算法使用Bootstrap method,重复次数为1 000)。所用生物信息学在线程序见表2。
图表编号 | XD0088104000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 王丽君、李艳青、谢舒平、石雨荷、朱敏、童巧珍、段礼新 |
绘制单位 | 湖南中医药大学、广州中医药大学、南京中医药大学、湖南中医药大学、广州中医药大学、湖南中医药大学、湖南省岳阳市中医院、广州中医药大学 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |