《表1 9种植物β-胡萝卜素羟化酶氨基酸相似性》

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《西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1-z基因的分离与生物信息学分析》

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从NCBI数据库中分别下载了拟南芥、辣椒、柑橘、番茄、水仙、玉米以及杜氏藻和红毛藻9种植物的β-胡萝卜素羟化酶蛋白氨基酸序列（表1）。通过DNAman v5.2，分别与CsBCH1-z氨基酸序列相似性比较，发现高等植物间β-胡萝卜素羟化酶氨基酸相似度比较高，其中与水仙的相似度最高为68.18%；不同物种间C端序列相对保守，N端的变异比较大，这可能是C端包含了羟化酶的活性功能域，因此在结构上趋于保守。通过MEGA5.1，进行9种植物β-胡萝卜素羟化酶的进化分析，构建了β-胡萝卜素羟化酶的进化树（图7），发现同一科属物种β-胡萝卜素羟化酶的亲缘关系更近，如同属茄科的辣椒和番茄，说明该基因的进化发生在植物分化的早期；而单子叶植物中，西红花的β-胡萝卜素羟化酶与同属于百合目水仙的β-胡萝卜素羟化酶亲缘关系更近，这可能与该酶参与有色物质的合成相关。通过基因结构对比，发现西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1和CsBCH2氨基酸序列相似性超过78%，都是由5个外显子组成且大小也很相似，由此可以推测西红花中该基因在基因组上的重复是较近发生的进化事件。