《表1 栽培花生种子发育过程转录组测序数据》

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《杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析》

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当前广泛种植的为四倍体栽培种花生，因此研究球蛋白基因在栽培种花生上的表达情况更有意义。从NCBI上的SRA（Sequence Read Archive）数据库下载栽培花生（Arachis hypogaea）种子发育过程的转录组测序数据[21]，登录号见表1。以杜兰落花生基因组（A基因组）和A.ipa3nsis基因组（B基因组）的合并基因组序列作为参考基因组，使用软件包HISAT2和StringTie进行转录组数据比对分析[22，23]，提取花生球蛋白基因的FPKM值（fragments per kilobase of transcript per million fragments mapped），重复样本取平均值，去除表达量较低的基因（FPKM值小于1），其余数值导入软件Mev 4.9进行热图绘制[24]。