《表2 mi R-M31-3p候选靶基因相关信息以及作用靶点分析》

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《与马立克病病毒编码的miR-M31-3p互作的宿主靶基因筛选与鉴定》

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备注:下划线表示种子序列特异性结合位点。Note:The underlined indicate the seed sequence specific binding sites.

利用杂交PCR构建与mi R-M31-3p互作的宿主候选靶基因cDNA文库，对共计946个文库菌落进行PCR鉴定。随机挑选360个阳性克隆菌落测序（占PCR菌落筛选总样38%），并进行序列比对分析，结果显示其中有159个克隆可在以NCBI中找到对应基因序列，排除重复序列后共获得77种宿主基因，其中49个与mi R-M31-3p互作的宿主基因的靶点位于3'-UTR中，经分析确定6个候选靶基因，分别为鸡GNPAT、TCF12、FIGNL1、CNDP2、MGST1和CD99L2靶基因（表2）。