《表1 桧柏丛枝锈菌冬孢子角rDNA ITS序列(541bp)》

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《北京地区桧柏丛枝状锈病病原菌的鉴定》


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以直接提取的冬孢子角基因组总DNA为模板,利用真菌通用引物ITS1和ITS4进行PCR扩增,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,长度为500bp左右(图3)。PCR产物连接至T载体,然后进行热激转化大肠杆菌,挑取17个阳性克隆进行序列测定,其中克隆2-8的序列长度为544bp;其余16个克隆长度均为541bp,其中11个克隆的序列中第76个碱基为鸟嘌呤G,而其它5个克隆在该位置上的碱基为腺嘌呤A,其余540个碱基完全相同,其碱基序列见表1。在www.ncbi.nlm.nlh.gov数据库中进行BLAST比对分析,由比对结果可知,克隆2-8的ITS+5.8S rDNA序列与Genebank已登录的Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici isolate 38(KY318499.1)序列相似性达到99.27%。其余克隆的ITS+5.8SrDNA序列与Genebank已登录的Gymnosporangium属真菌(taxid:526)的rDNA序列进行比对分析,其167-325和486-541碱基序列与鸟巢状胶锈菌(G.nidus-avis)菌株RSP 05-29的rDNA(KJ720181.1)的1924-2080和2339-2394序列的相似性为分别为85%和93%,因此北京地区发现的桧柏丛枝状锈菌为鸟巢状胶锈菌(G.nidus-avis)。