《表1 桧柏丛枝锈菌冬孢子角rDNA ITS序列(541bp)》
以直接提取的冬孢子角基因组总DNA为模板,利用真菌通用引物ITS1和ITS4进行PCR扩增,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,长度为500bp左右(图3)。PCR产物连接至T载体,然后进行热激转化大肠杆菌,挑取17个阳性克隆进行序列测定,其中克隆2-8的序列长度为544bp;其余16个克隆长度均为541bp,其中11个克隆的序列中第76个碱基为鸟嘌呤G,而其它5个克隆在该位置上的碱基为腺嘌呤A,其余540个碱基完全相同,其碱基序列见表1。在www.ncbi.nlm.nlh.gov数据库中进行BLAST比对分析,由比对结果可知,克隆2-8的ITS+5.8S rDNA序列与Genebank已登录的Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici isolate 38(KY318499.1)序列相似性达到99.27%。其余克隆的ITS+5.8SrDNA序列与Genebank已登录的Gymnosporangium属真菌(taxid:526)的rDNA序列进行比对分析,其167-325和486-541碱基序列与鸟巢状胶锈菌(G.nidus-avis)菌株RSP 05-29的rDNA(KJ720181.1)的1924-2080和2339-2394序列的相似性为分别为85%和93%,因此北京地区发现的桧柏丛枝状锈菌为鸟巢状胶锈菌(G.nidus-avis)。
图表编号 | XD0080614000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.20 |
作者 | 周江鸿、夏菲、车少臣 |
绘制单位 | 园林绿地生态功能评价与调控技术北京市重点实验室北京市园林科学研究院、园林绿地生态功能评价与调控技术北京市重点实验室北京市园林科学研究院、园林绿地生态功能评价与调控技术北京市重点实验室北京市园林科学研究院 |
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