《表2 与深海相关的环境病毒组学研究》
宏基因组学及宏病毒组学技术和分析手段的飞速发展,显著地增加了我们对深海中未培养病毒的认知(表2).通过从深海环境样品中分离及纯化病毒颗粒,进而提取病毒DNA并完成高通量测序,再通过后续的序列拼接和组装,就有可能得到完整的病毒基因组信息[28].比如Anantharaman等人[70]对劳盆地及瓜伊马斯热液区的热液羽流样品的宏病毒组(2224498684 reads)进行分析,获得了18个dsDNA病毒的完整基因组.另一种方式是从宏基因组数据中将病毒的信息提取出来,这样可得到整合于宿主基因组中的病毒序列信息,如Mizuno等人[27]首次通过这种方法从深海海水宏基因组中得到了多个完整的病毒基因组.这些通过组学方法获得的病毒基因组信息,可以提供大量未培养病毒的种属、类型、宿主等信息,将有助于指导某些特定病毒的针对性分离工作.
图表编号 | XD0069549800 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.05.30 |
作者 | 蹇华哗、肖湘 |
绘制单位 | 上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室、上海交通大学海洋工程国家重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |