《表1 体系组成及模拟条件》

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《三氯叔丁醇和甘露醇高温下影响缩宫素稳定性的分子模拟研究》

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在GROMACS软件中，构建25 nm×25 nm×25 nm的盒子，随机插入15条还原态缩宫素分子和400个分散剂（三氯叔丁醇或甘露醇），然后加入10 000个水，最后加反离子使体系电荷呈中性，共得到了6个体系（见表1）。首先采用最速下降法对体系进行能量最小化，然后进行100 ps的NVT模拟，体系初步平衡后，进行10 ns的NVT模拟，每20 ps保存一次轨迹，积分时间步长设为2 fs。温度耦合采用V-rescale方法，参考温度分别设为300和500 K，库伦和范德华截断半径均设为1.4 nm，采用Particle Mesh Ewald（PME）方法考虑静电作用。所有计算均在GROMACS 5.1[14]软件包中执行。