《表3 测序深度及覆盖度统计》
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《大白菜抗TuMV显性位点F_2的QTL-seq分析》
注:1×覆盖度,1个碱基覆盖的位点占基因组的百分比;4×覆盖度,4个碱基覆盖的位点占基因组的百分比。Note:Coverage 1×,the percentage of one base covering the genome;coverage 4×,the percentage of four bases covering the genome.
测序Reads与参考基因组比对,所有样本的比对率在92.8%~93.75%之间,表明样本测序数据与参考基因组相似度高;对参考基因组(排除N区)的平均覆盖深度在22.42×至48.52×之间,1×覆盖度(至少有1个碱基的覆盖)在91.54%以上,覆盖深度和覆盖度能够直接反应测序数据的均一性及与参考序列的同源性(表3)。比对结果正常,可用于后续的变异检测及相关分析。
图表编号 | XD0061570700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.25 |
作者 | 李国亮、张淑江、钱伟、李菲、章时蕃、张慧、方智远、孙日飞 |
绘制单位 | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
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