《表1 映山红和皋月杜鹃数据量统计》

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《杜鹃花属映山红与皋月杜鹃的基因组调查》

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原始测序质量评估可以大致从两个方面来看：第一，从碱基分布来看：碱基A、T、C、G的含量分布根据互补原则，A和T的比例以及C和G的比例一般较为接近。第二，从测序质量分布来看：位置越高质量越高，Illumina测序普遍头部（5'端）质量值较高，尾部（3'端）质量值偏低。碱基含量分布方面，由于二代测序本身的特性，前几个bp碱基含量有波动，其它位置AT含量基本持平，GC含量基本持平，总体碱基含量分布正常（图1）；而测序数据的平均质量主要分布在Q30以上，说明原始测序质量较高，能较好保证后续分析的正常进行（表1）。