《表1 过滤后的reads质量统计》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《水稻叶片响应细菌性条斑病侵染的转录组分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

分别取细菌性条斑病侵染前（B＿1）和侵染后20 d（B＿2）水稻叶片，对样品文库进行了RNA-Seq测序，分别获得raw reads 69.73×106条和69.73×106条，去除含Adapter的reads、低质量的reads（质量值低于15碱基的reads）、N的比例（未知碱基N含量大于5%的reads的数目）。数据经过滤后二者高质量序列数分别为66 618 616条和66 271 164条，将量控后得到的序列进行测序拼接，侵染前（B＿1）获得23 845条U-nigene，最长的Unigene为29 236 bp，最短的Unigene为179 bp，平均长度为2 019 bp。侵染20 d后（B＿2）获得24 932条Unigene，最长的Unigene为29 236 bp，最短的Unigene为177 bp，平均长度为2 009 bp。拼接后结果的匹配率分别为95.54%和95.04%。小于20%（Q20）的片段去掉，两个样本大于Q20测序结果分别为98.09%和97.95%（表1）。结果表明测序质量合格，可进行下一步的生物学分析。