《表2 高粱LEA家族基因详细信息》

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《高粱LEA基因家族的鉴定及表达分析》

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为了获得潜在的高粱LEA基因家族成员，我们根据已分组的模式植物拟南芥的51个LEA蛋白序列分别构建了7个隐马尔可夫模型（HMM）文件，并利用这些HMM文件去检索高粱基因组蛋白数据库sorghum bicolor V3.1.1 (protein＿primary），后续利用Pfam数据库对初步检索出的结果进行保守结构域的确定，从而在高粱基因组中鉴定出35个SbLEA基因，根据保守结构域的不同将其分为7组，分别为LEA＿1、LEA＿2、LEA＿3、LEA＿4、LEA＿5、Dehydrin和SMP，并结合SbLEA基因染色体位置信息依次命名（表2）。除SbLEA8和SbLEA12外所有的高粱SbLEA蛋白都显示出高度的亲水性，总平均亲水性（GRAVY）的范围从0.118到-1.382（数值越小，表示亲水程度越高）；蛋白等电点（pI）的范围从11.63到4.17；分子量的大小范围从8.64×103到43.82×103（表2）。