《Table 2 Gene ontology enrichm ent analysis》

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《"茄青枯拉尔氏菌Rs-T02在3,4,5-三羟基苯甲酸甲酯作用下的转录组分析"》

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分析有功能注释的DEGs与GO分类中某几个特定分支的超几何分布关系，获得富集最显著的28个GO term（表2）。从表2可以看出，生物过程分类下，富集显著程度最高的GO term有纤毛或鞭毛依赖的细胞运动（cilium or flagellum-dependent cell motility）、细菌型鞭毛依赖性细胞运动（bacterial-type flagellum-dependent cell motility）和古细菌或细菌型鞭毛依赖的细胞运动（archaeal or bacterial-type flagellum-dependent cell motility）等，其中与纤毛或鞭毛依赖的细胞运动相关的DEGs有20个上调表达，这些DEGs包含鞭毛钩蛋白（flagellar hook protein）flgB、flg C、flgD、flgE、flgF和flgH等基因。根据分子功能分类，富集显著程度最高的GO term有RNA甲基转移酶的活性（RNA methyltransferase activity）、tRNA结合（tRNA binding）和tRNA（鸟嘌呤-N7-）-甲基转移酶的活性[tRNA（guanine-N7-）-methyltransferase activity]等，RNA甲基转移酶的活性相关的DEGs有18个上调表达。获得富集最显著的28个GO term中没有发现与细胞组分大类相关的GO term。