《表1 组装结果统计Tab.1 Assembly quality of M.rosenbergii ovary transcriptome》

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《罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)卵巢发育不同时期转录组分析》

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根据罗氏沼虾卵巢发育的4个不同时期的卵巢样品，建立了4个单独的测序文库，通过Illumina HiSeqTM 4000高通量测序，获得卵巢4个期Raw reads序列条数分别为47927784、70553888、57962050、54377814，经原始数据过滤后，得到Clean reads共221580604条，4个时期分别为45860872、67775028、55624580、52320124条。原始数据过滤后，Q20%（Phred数值大于20的碱基占总体碱基的百分比）有明显提高，达到98%左右。使用Trinity软件对转录组进行de novo组装，结果表明，组装得到的Unigene长度范围为201—14658bp，4个时期样品总共组装得到平均长度为766.29bp的Unigene序列95379条，平均GC含量为38.96%（表1）。