《表1 8种细菌中第二类羊毛硫肽合成酶一致性比较》

《表1 8种细菌中第二类羊毛硫肽合成酶一致性比较》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《解淀粉芽胞杆菌WS-8中LanM基因的克隆及生物信息学分析》


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几种不同芽胞杆菌中第二类羊毛硫肽合成酶一致性的比较(表1)。通过构建系统发育树,第二类羊毛硫肽合成酶LanM与同源蛋白的亲缘关系(图2),几种芽胞杆菌的合成酶被分成2个聚类。其中地衣芽胞杆菌DSM13单独为一聚类;而其它芽胞杆菌为一聚类,这一聚类又分为4个分枝:解淀粉芽胞杆菌WS-8、贝莱斯芽胞杆菌和枯草芽胞杆菌聚为一分枝,苏云金芽胞杆菌和耐盐短杆菌聚为一分枝,蜡样芽胞杆菌和乌鲁木齐类芽胞杆菌各为一分枝。其中解淀粉芽胞杆菌WS-8中的LanM蛋白与贝莱斯芽胞杆菌中的LanM家族修饰蛋白位于同一结点,遗传距离相同,亲缘关系最近。而解淀粉芽胞杆菌WS-8中的LanM蛋白与地衣芽胞杆菌DSM13中的羊毛硫肽修饰蛋白亲缘关系最远。对比LanM同源蛋白和LANC_like结构域的系统发育树发现,除了遗传距离稍有差异,LANC_like结构域的亲缘关系与LanM同源蛋白的亲缘关系高度一致(图3)。因此推断LANC_like结构域在LanM蛋白中的保守性也许决定了LanM的亲缘关系。