《表2 Lib Dock得分及活性位点周围氨基酸残基Table 2 The Lib Dock score and key amino acid residues around active sites

《表2 Lib Dock得分及活性位点周围氨基酸残基Table 2 The Lib Dock score and key amino acid residues around active sites   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究》


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通过计算分析,在NDRG3蛋白三维结构中找到14个潜在活性位点,其中位点2~9位于蛋白表面,它们是药物分子易于结合的位点,其它较难结合的位点存在于蛋白内部.将L-Lactate对接到NDRG3蛋白的各个位点中,发现除了位点11~13外,其它位点全部对接成功,结果中的Lib Dock得分如表2所示,其中L-Lactate与NDRG3蛋白在位点2处的Lib Dock得分最高(54.651),说明位点2是两者的最佳结合位点,其次分别为位点4、3、5.统计活性位点周围的氨基酸残基(表2),发现Lib Dock得分大于50分的位点均存在His、Gly、Ser、Asn这4种氨基酸,结果表明:这些氨基酸对NDRG3蛋白与L-Lactate的结合发挥重要作用.