《表1 甜荞Fe HSF家族基因》

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《甜荞热激转录因子基因家族的鉴定及生物信息学分析》


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通过Blastp比对和CDD分析,甜荞的23个非冗余的HSF基因被鉴定,将它们命名为Fe HSF1、Fe HSF2、……Fe HSF23(表1)。23个Fe HSF蛋白中,Fe HSF15所含的氨基酸(227)最少,Fe HSF11所含的氨基酸(538)最多;蛋白相对分子质量为25 750~61 460;蛋白预测的理论等电点为4.39~9.19。表明不同的Fe HSF蛋白可能在不同的微环境中发挥其功能(表1)。基因结构分析显示,23个Fe HSF基因均含有内含子,除Fe HSF11含有7个内含子外,其余22个HSF基因均只含有1个内含子(图1)。