《表2 TargetRNA2程序预测能与GcvB 3个功能基序碱基配对的靶基因》

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《鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB靶基因筛选和验证分析》

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注：不同功能序列在GcvB中的位置，R1（66、92），R2（136、145），R3(150、175）。

利用TargetRNA2程序预测能与STM LT2 GcvB R1、R2或R3功能基序碱基互补配对的靶基因。结果显示，共预测到6个能与GcvB R1功能基序形成至少10个连续碱基互补配对的靶基因，5个能与GcvB R2功能基序形成至少7个连续碱基互补配对的靶基因，5个能与GcvB R3功能基序形成至少7个连续碱基互补配对的靶基因，且所有预测结果p值均小于0.05，均符合预设值标准（表2）。以上结果表明，本研究共预测到GcvB靶基因16个，包括与GcvB R1功能基序匹配的6个靶基因STM1856、metF、mltC、sbp、yhhT和yaeC；与GcvB R2功能基序匹配的5个靶基因narY、sgbE、ybbP、speG和ybbA；以及与GcvB R3功能基序匹配的5个靶基因gshA、STM0849、yihU、ampH和aroF。