《表1 耐胆盐微生物的鉴定分析》

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《基于MALDI-TOF-MS和高通量测序分析耐胆盐微生物群落》

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注:高通量测序中，Enterobacter，Pantoea，Pseudomonas，Escherichia-Shigella，Cronobacter注释来源于SILVA的SSUr RNA数据库；Klebsiella，Erwinia注释来源于Mi Seq 16S Metagenomics report；\""-\"":未注释

通过平板筛选和MALDI-TOF-MS鉴定手段，有8个品种的29批样品检出耐胆盐革兰阴性菌，鉴定菌株31种，分别归属于克罗诺杆菌属（Cronobacter）、肠杆菌属（Enterobacter）、欧文氏菌属（Erwinia）、埃希氏菌属（Escherichia）、泛菌属（Pantoea）、克雷伯菌属（Klebsiella）、爱文氏菌属（Ewingella）、拉乌尔菌属（Raoultella）、假单胞菌属（Pseudomonas）和勒克氏菌属（Leclercia）等10个属。高通量测序得到9个菌属的注释结果，各组优势菌属主要为肠杆菌属和泛菌属，不同品种中还注释有假单胞菌属、克罗诺杆菌属、芽孢杆菌属（Bacillus）或埃希-志贺菌属（EscherichiaShigella）等；与MALDI-TOF-MS方法相比，缺少勒克氏菌属、拉乌尔菌属和爱文氏菌属的注释结果，但是发现了传统培养方法未鉴定出的菌属，如芽孢杆菌属和柠檬酸菌属（Citrobacter）（表1）。