《表4 乌桕多态性SSR引物》

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《基于转录组序列的乌桕SSR分子标记开发》


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以来自不同地理群体的6个乌桕样本(‘江苏新沂19’‘河南商城2’‘湖北大悟7’‘湖北罗田14’‘安徽黟县13’和‘浙江兰溪8’)的基因组DNA作为模板,进行SSR引物的有效性筛选。SSR-PCR扩增电泳图谱显示,在设计的120对SSR引物中,38对能有效扩增出预期大小的SSR片段(图1)。对这38对SSR引物进行荧光标记和PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳检测和STR分型,进一步筛选出扩增效率高、稳定性好的多态性SSR引物10对,均为两碱基和三碱基重复单元(表4)。其中,Ts_SSR058引物的电泳检测结果显示,该引物在6个个体中表现出较高的多态性(图2)。