《表1 Lnc RNA数据库汇总》

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《生物信息学辅助研究乳腺癌转移相关lncRNA进展》


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目前对于lnc RNA的研究多采用染色质免疫共沉淀技术收集lnc RNA,用微阵列(microarrays)、平铺阵列(tiling arrays)、转录组测序技术(RNA-seq)发现差异表达并鉴定[3]。随着生物信息学的迅猛发展,将新一代高通量测序技术与生物计算方法联合使用,出现了大量lnc RNA测序信息并因此建立了很多相关生物信息数据库,使得对lnc RNA的研究更加便捷。目前已有的lnc RNA数据库包括Lnc RNAdb、NONCODE、Rfam、Lnc RNAdisease、Cuilab、UCSC、GENCODE、NRED、lncipedia等,这些数据库收录了lnc RNA序列及其相关信息,各常用lnc RNA数据库特点简要介绍见表1。