《表3 Reads与参考基因组比对情况》

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《转录组学解析茉莉酸甲酯对双孢蘑菇个体大小的影响机制》

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为了检查测序得到的基因文库是否满足后续基因表达的计算，将有效序列与指定的参考基因组进行序列比对，获取在参考基因组或基因上的位置信息，以及测序样品特有的序列特征信息。由表3可知，转录组测序获得的有效序列中，能定位到基因组上的序列片段占比均在92.97%～94.34%范围内。在参考序列上，具有多个比对位置的序列片段占比均在0.98%～1.18%范围内；具有唯一比对位置的序列片段占比在91.79%～93.36%范围内；比对到基因组上正链的序列片段占比在45.88%～46.67%范围内，比对到负链上的序列片段占比均在45.91%～46.69%范围内。定位到基因组上的序列片段中，能整段比对到外显子占比在53.28%～55.08%范围内，分段比对到外显子占比在38.22%～39.12%范围内。该结果表明所有文库基本检测到了组织内所有表达的基因，满足后续基因的表达计算。