《表1 新分离的等位基因与已报道等位基因的比较》

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《直接测序法构建圈养大熊猫MHC遗传档案》

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注:Nucl、AA、ABS分别表示等位基因核苷酸序列、氨基酸序列和抗原结合位点，长度分别为546 bp、182 bp和56 bp

利用直接测序分型方法，从91只大熊猫中分离到45条MHC等位基因（22条Ⅰ类MHC等位基因和23条Ⅱ类MHC等位基因）。与已报道的Ⅰ类和Ⅱ类MHC等位基因进行比对，发现了3条新的等位基因，1条来自Aime-I，命名为Aime-I*08；2条来自Aime-L，命名Aime-L*08和Aime-L*09。对于Aime-I位点，新等位基因Aime-I*08与已报道的Aime-I*01～07的差异核苷酸个数为26～35，差异氨基酸个数为13～16，ABS的差异氨基酸个数为9～12。对于Aime-L位点，新等位基因Aime-L*08与已报道的Aime-L*01～07差异核苷酸个数、差异氨基酸个数、ABS的差异氨基酸个数分别为1～26、1～15、1～11；新等位基因Aime-L*09与已报道的Aime-L*01～07的差异核苷酸个数、差异氨基酸个数、ABS的差异氨基酸个数分别为2～17、1～9、0～7。Aime-L*08与Aime-L*02核苷酸序列相似度为99.8%（1个碱基差异），氨基酸序列相似度为99.5%（1个氨基酸差异且位于ABS上）。Aime-L*09与Aime-L*03、Aime-L*04均具有2个核苷酸差异（相似度99.6%）和1个氨基酸差异（相似度为99.5%）。但Aime-L*09与Aime-L*04具有完全相同的ABS（表1；图2）。