《表1 D.zeae CE1全基因组序列与其他D.zeae菌株的ANI、AP和is DDH值》
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《引起芭蕉芋细菌性软腐病的玉米迪基氏菌(Dickeya zeae)CE1的全基因组序列及比较基因组学分析》
通过基于9个保守基因串联序列的进化树分析发现,13个属于D.zeae种的菌株和1个种外的对照菌株D.dadantii 3937可分成明显的两类;而D.zeae种的菌株可分为三小类(图2),分别为:(1)水稻菌株EC1、ZJU1202、DZ2Q和EC2,以及其他菌株如CSL RW192、NCPPB 3531和Ech586;(2)芭蕉芋菌株CE1和香蕉菌株MS1、MS2,以及其他菌株如NCPPB 3532和MK19;(3) NCPPB2538。其中,水稻菌株EC1、ZJU1202、EC2和芭蕉芋菌株CE1及香蕉菌株MS1、MS2均是分离于广东的病原菌。芭蕉芋菌株CE1和其他D.zeae菌株的ANI、AP和is DDH值与进化树分析反映的菌株间亲缘关系类似,CE1和香蕉菌株MS1、MS2以及其他菌株NCPPB 3532、MK19间的ANI、AP、is DDH值相较于CE1和以水稻菌株为主的第一类菌株的值要大(表1)。
图表编号 | XD00197491800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.20 |
作者 | 张景欣、沈会芳、蒲小明、孙大元、杨祁云、林壁润 |
绘制单位 | 广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室、广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室、广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室、广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室、广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室、广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室 |
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