《表2 SNP ED方法分析关联区域》

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《大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因的挖掘》


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为达到消除背景噪音的功能,采用原始ED的2次方作为关联值,然后采用DISTANCE方法对ED值进行拟合,获得SNP关联值分布情况(图2)。用所有位点拟合值的median+3SD,即0.21 (Hill et al.,2013),作为关联阈值。以此关联阈值判定,得到共包含805个基因,总长度4.41 Mb的2个区域(表2),其中共334个基因含有非同义突变SNP位点。