《表1 Rc PLD亚细胞定位预测》

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《砂藓抗旱相关基因磷脂酶D的克隆和表达分析》


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对Rc PLD进行亚细胞定位预测,预测结果显示,Rc PLD定位在线粒体的概率为0.152,细胞外的概率为0.630,其他位置0.083 (表1)。使用PORTER软件对Rc PLD的二级结构进行预测,结果显示Rc PLD的二级结构中,琢螺旋占总数的26.26%,延伸链和无规则卷曲分别占21.55%和52.19%(图6)。对Rc PLD的保守结构域进行分析,预测结果表明,Rc PLD属于磷脂酶D超家族(图7),使用NCBI中的BLASTp程序,查找与Rc PLD氨基酸序列一致性较高的PLD序列,并使用MEGA5.0软件对找到的序列构建系统发育树(图8)。