《表3 BRI1蛋白家族成员的导肽预测》
注:*:不能确定具有何种导肽;-:未发现导肽分裂位点;S:分泌途径信号肽;C:叶绿体转运肽;可靠性:数值越小,越可靠
导肽(Leaderpeptide)是一段用于将新合成的肽链引导进入到不同的细胞器中的识别蛋白(董娇等,2010)。利用网站“Target P 1.1 Server”在线预测所有植物BRI1家族成员序列,选择特异性(Specificity)为0.95。得到结果为,菠萝蜜3条蛋白中,Ah BRI1导肽预测可靠性为1级,且在蛋白序列的第21位存在一个导肽分裂位点,信号肽区为前21个氨基酸残基,成熟蛋白从第22位点开始启动(表3)。分析可能存在分泌途径信号肽;Ah BRL2的导肽预测可靠性为3级,可能具有信号肽,且预测在蛋白序列的第28位存在一个导肽分裂位点,信号肽区为1~28氨基酸残基之间,成熟蛋白的启动位点为第29位点;但Ah BRL1分泌途径信号肽预测分数较低,由可靠性推测AhBRL1的导肽可能为不同于Ah BRI1和Ah BRL2导肽种类的叶绿体转运肽。Mn BRL1、Pt BRL2_1、Pt BRL2_2和3条拟南芥蛋白At BRI1、At BRL1和At BRL3的导肽预测可靠性较高,并且均存在导肽分裂位点,说明很有可能具有分泌途径信号肽。而At BRL2、Pt BRL3_1和Pt BRL3_2可靠性较低,且也未发现其导肽分裂位点,所以无法确定其是否具有导肽。
图表编号 | XD00194402800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.14 |
作者 | 杨欣蓉、于旭东、吴繁花、蔡泽坪、罗佳佳、曹佩娜 |
绘制单位 | 海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室、海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室、海南大学生命科学与药学院、海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室、海南大学热带作物学院、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室、海南大学林学院热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室 |
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