《表3 BRI1蛋白家族成员的导肽预测》

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《菠萝蜜BRI1家族成员生物信息学的预测与对比》


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注:*:不能确定具有何种导肽;-:未发现导肽分裂位点;S:分泌途径信号肽;C:叶绿体转运肽;可靠性:数值越小,越可靠

导肽(Leaderpeptide)是一段用于将新合成的肽链引导进入到不同的细胞器中的识别蛋白(董娇等,2010)。利用网站“Target P 1.1 Server”在线预测所有植物BRI1家族成员序列,选择特异性(Specificity)为0.95。得到结果为,菠萝蜜3条蛋白中,Ah BRI1导肽预测可靠性为1级,且在蛋白序列的第21位存在一个导肽分裂位点,信号肽区为前21个氨基酸残基,成熟蛋白从第22位点开始启动(表3)。分析可能存在分泌途径信号肽;Ah BRL2的导肽预测可靠性为3级,可能具有信号肽,且预测在蛋白序列的第28位存在一个导肽分裂位点,信号肽区为1~28氨基酸残基之间,成熟蛋白的启动位点为第29位点;但Ah BRL1分泌途径信号肽预测分数较低,由可靠性推测AhBRL1的导肽可能为不同于Ah BRI1和Ah BRL2导肽种类的叶绿体转运肽。Mn BRL1、Pt BRL2_1、Pt BRL2_2和3条拟南芥蛋白At BRI1、At BRL1和At BRL3的导肽预测可靠性较高,并且均存在导肽分裂位点,说明很有可能具有分泌途径信号肽。而At BRL2、Pt BRL3_1和Pt BRL3_2可靠性较低,且也未发现其导肽分裂位点,所以无法确定其是否具有导肽。