《表3 HSP70的氨基酸序列一致率(斜线左)和相似率(斜线右)(%)》

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《甘蓝型油菜热激蛋白HSP70基因家族的鉴定和分析》


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为验证系统发育树分析结果,本研究经过Vector NTI上的两两比对得到了芸薹属HSP70蛋白家族的氨基酸一致率和相似率(表3),发现3个芸薹属物种的HSP70基因同源性极高,均大于96%,甚至达到99.8%。2个基本种种间HSP70蛋白水平的平均一致率为98.2%,平均相似率为98.9%。白菜种内的HSP70蛋白一致率为98.2%,相似率为98.9%;甘蓝种内的HSP70一致率为97.1%,相似率为98.3%;白菜种内的HSP70一致率和相似率比甘蓝种内略高。所有两两比对的一致率均大于96.2%,相似率均大于97.9%。白菜与甘蓝型油菜之间的HSP70平均一致率为98.6%,平均相似率为99.13%;甘蓝与甘蓝型油菜之间的HSP70平均一致率为98.36%,平均相似率为98.98%;白菜与甘蓝型油菜HSP70之间的同源性高于甘蓝与甘蓝型油菜。甘蓝型油菜种内HSP70的平均一致率为98.28%,平均相似率为99.0%。