《表2 紫果西番莲基因组拼接结果统计》

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《紫果西番莲基因组调查及SSR特征分析》

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过滤测序数据中低质量序列后，选择K-mer为65，用SOAP denovo软件进行初步组装和拼接。Contig N50为469 bp，Contig最大长度为34 957 bp，总长度1 758 960 828 bp （约1 759 Mb）；然后利用reads之间的连接关系和插入片段大小信息将Contigs组装成Scaffolds，Scaffold N50长度为582 bp，最大长度达到40 198 bp，总长度为1 768 204 194 bp （表2）。组装得到基因组序列总长度1 759 Mb与预测的基因组大小1 051 Mb存在一定的差异，这可能是基因组中重复序列含量较高而引起的误差。