《表1 扶桑绵粉蚧内共生菌丰度(前10)》

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《基于宏基因组测序的扶桑绵粉蚧内共生菌多样性研究》


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括号内数据表示相对丰度(%);

根据注释结果,样本共鉴定获得29个门,47个纲,105个目,178个科,245个属,299个种。在界分类水平上,扶桑绵粉蚧内共生物测序共注释了古细菌Archaea、细菌Bacteria、真核生物Eukaryota和病毒Viruses;细菌为优势种群,相对丰度达85.16%。在门分类水平上,共注释了子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota、Candidatus Magasanikbacteria等29个门;其中变形菌门Proteobacteria为优势种群(相对丰度81.36%)。在纲分类水平上,共注释了α-变形菌纲Alphaproteobacteria、β-变形菌纲Betaproteobacteria、衣原体纲Chlamydiia等47个纲;γ-变形菌纲和β-变形菌纲为优势种群,相对丰度远超其他种群(分别为50.04%和27.68%)。在目分类水平上,共注释了交替单孢菌目Alteromonadales、伯克氏菌目Burkholderiales、弯曲菌目Campylobacterales等105个目;肠杆菌目Enterobacterales为优势种群(相对丰度42.65%)。在科分类水平上,共注释了酸杆菌科Acetobacteraceae、芽孢杆菌科Bacillaceae、弯曲菌科Campylobacteraceae、Debaryomycetaceae等178个科;肠杆菌科Enterobacteriaceae为优势种群(相对丰度33.48%)。在属分类水平上,共注释了醋酸杆菌属Acetobacter、芽孢杆菌属Bacillus、Caballeronia等245个属;伯克氏菌属Burkholderia为优势种群(相对丰度13.12%);Candidatus Tremblaya相对丰度3.69%排名第二。在种分类水平上,共注释了Acetobacter malorum、脆弱类杆菌属Bacteroides fragilis、Caballeronia grimmiae等299个种;相对丰度为2.58%的Candidatus Tremblaya phenacola为优势种群(表1)。