《表1 基因扩增所用引物信息》

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《2株圣乔治教堂诺卡菌的鉴定与药物敏感性分析》


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用水煮裂解法提取DNA[6]。参照文献[7-8]合成原核生物16S r RNA基因通用引物8F、1492R和hsp65基因引物,并参照文献反应条件进行。引物与扩增信息见表1。用2×Taq PCR Mix预混液配制体系。扩增产物经15 g/L琼脂糖凝胶电泳观察,交由上海生工公司进行产物纯化并在ABI 3730型DNA测序仪上行Sanger双向测序。测序结果截去引物结合区并选取QV值>25的片段,以Blast比对搜索Gen Bank数据库。以MEGA 5.0软件构建16S r RNA基因与hsp65基因系统进化树,用邻接法与Kimura两参数模型,进化树拓扑枝以Bootstrap法自举检验1 000次。龟分枝杆菌作为系统进化树外枝。