《表5 hsEH和化合物21结合8ns后平衡的平均结构结合自由能》
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《基于分子对接、分子动力学模拟的新型酰胺-膦酸酯类hsEH抑制剂的QSAR研究》
注:ΔGbind=Evdw+Eele+ΔGpol+ΔGnppol+TS,其中熵变忽略不计.
计算出hsEH-化合物21体系在生理条件下的结合自由能(ΔGbind).提取的复合物在平衡8ns时的构象的各能量如表5所示.其中范德华作用能(Evdw)、非极性溶剂化能(ΔGnppol)的值均远小于零,表明范德华力以及非极性的溶质环境有利于酰胺-膦酸酯类衍生物与hsEH的结合,可见结合过程中疏水作用力和氢键作用力的重要性.而真空中的静电作用能值较小(Eele),表明静电相互作用力影响较小,可能源于π-π堆积电子云吸引作用力.动力学模拟的结果与QSAR中的各力场的贡献率和分子对接结果表现一致.
图表编号 | XD0018986500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.01 |
作者 | 易忠胜、段家喜、聂瑾芳、赵赛 |
绘制单位 | 桂林理工大学化学与生物工程学院广西高校食品安全与检测重点实验室岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心、桂林理工大学化学与生物工程学院广西高校食品安全与检测重点实验室岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心、桂林理工大学化学与生物工程学院广西高校食品安全与检测重点实验室岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心、桂林理工大学化学与生物工程学院广西高校食品安全与检测重点实验室岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心 |
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