《表1 基因扩增及实时荧光定量PCR引物》
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《紫苜蓿盐诱导NAC转录因子的鉴定、克隆及表达分析》
植物中转录因子对盐胁迫的响应通常包含两类:一类为早期响应(一般在胁迫0.5~3 h内响应表达),另一类为中晚期响应(通常在胁迫处理6~24 h时诱导或抑制表达),因此,早期盐胁迫处理我们选取1 h时间点取材,中晚期盐胁迫处理选择24 h时间点取材(选取该时间点亦是为了避免光周期对基因表达的影响)。转录组测序由北京诺和生物技术公司完成。转录因子筛选参考Zheng等(2016)和董蔚等(2018)。简要描述为:对照(0 h)及盐胁迫处理1、24 h样品的测序片段经拼接、组装后,利用hmmscan软件对测序片段进行预测分析,然后利用加权截尾均值(trimmed mean of M-values,TMM)法对测序数据进行标准化处理,筛选差异表达基因[筛选标准为q≤0.005且|log2(变化倍数)|≥1]。获得差异表达基因后,将它们与蒺藜苜蓿(M.truncatrula)基因组数据库进行序列比对分析,获得其最为同源的基因,然后根据同源基因设计引物进行序列扩增(引物见表1)。
图表编号 | XD00181516000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.20 |
作者 | 宋玉光、张召然、吕娇、马宗琪、董蔚 |
绘制单位 | 曲阜师范大学生命科学学院、曲阜师范大学生命科学学院、曲阜师范大学生命科学学院、曲阜师范大学生命科学学院、曲阜师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |