《表1 SNP分型位点扩增引物序列》
将实验室保存的20株不同型别的国内MP临床分离株的Illumina Hiseq 2000全基因组测序数据与NCBI数据库中49株MP全基因组序列使用Mauve软件进行全基因组序列比对,并使用SNP stats软件进行MP全基因组SNP分析,获取全部SNP位点。选取多态性大于5%的34个SNP位点作为初筛位点,使用Primer Premier 5软件对上述34个SNP位点分别设计扩增引物(表1),由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。
图表编号 | XD00180024000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 刘立雍、龚杰、徐娟、何利华、孟凡亮、张建中、赵飞 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制 |
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