《表3 化合物结合Survivin蛋白函数模拟结果》
积雪草酸衍生物Ⅰ~Ⅲ类均具有与Survivin蛋白(PDB编号:3UIH)较强的结合能力.Molegro virtual docker(M VD)软件能够预测和计算靶蛋白与目标化合物的相互作用和能量,通过函数打分将结果通过数值直观表达(表3),Escore表示对接评分函数(MloDock Score,Escore=Einter+Eintra,Einter表示配体-蛋白质相互作用能量,Eintra表示配体内部能量).能量分数的绝对值越大,结合亲和力越强.使用MVD 6.0,结合分数显示:自身小分子配体分数为-75.542,其中化合物Ⅱ4为-85.519,化合物Ⅲ4为-89.105,这两种化合物的分数绝对值都高于自身配体.通过Discovery Studio 4.0对上述化合物与靶点直接分析,结果显示:化合物Ⅱ4、Ⅲ4能够很好地嵌入到Survivin的活性口袋中,其中LYS62、GLU65等关键氨基酸可以通过疏水键、氢键与化合物紧密相连(图2、图3).
图表编号 | XD00172140900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.01 |
作者 | 李孝孝、佟贺、孟艳秋 |
绘制单位 | 沈阳化工大学制药与生物工程学院、沈阳化工大学制药与生物工程学院、沈阳化工大学制药与生物工程学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |