《表1 9类锌指蛋白的序列及其代表蛋白质》

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《植物锌指蛋白转录因子家族研究进展》

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根据锌指蛋白在指状二级结构中与锌离子结合的半胱氨酸和组氨酸残基的数量和顺序的不同，Berg和Shi将锌指蛋白分为9大类：C2H2、C8、C6、C3HC4、C2HC、C2HC5、C4、C4HC3和CCCH（C和H分别代表半胱氨酸和组氨酸）（表1）[9]；根据锌指Cys和His残基所构成的空间结构不同，Krishna等[10]把锌指蛋白分成8个不同的折叠群：类C2H2型锌指、高音谱号锌指、带状锌指、塞结状锌指、Zn2/Cys6型锌指、类TAZ2型锌指、锌离子结合短环锌指、金属硫蛋白锌指，其中前3类组成了大部分的锌指[10]；根据锌指蛋白的功能差异，可分为TFIII蛋白、WRKY蛋白、RING蛋白、GATA蛋白、PHD蛋白、DOF蛋白等亚家族。