《表1 AOB与AOA在细胞结构及代谢途径上的关键特征》

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《控制氮肥施用引起的活性氮气体排放：脲酶/硝化抑制剂研究进展与展望》

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AOA和AOB的氨基酸序列相似度仅40%[25]，二者在细胞结构及代谢途径方面还存在诸多差异（表1）。研究表明，AOA为酸性土壤中的主要氨氧化微生物，有的AOA菌株能在pH为4的环境下进行氨的氧化[26]。AOA适应低pH环境，可能与其基因组中含有大量脲酶编码基因有关，使其能够利用环境中的脲素作为氨氧化的基质[26]；此外，AOA可能利用低pH下质子化的氨做基质，也是它在酸性环境中优势明显的原因之一[27]。农业土壤中氨氮浓度在人为施肥后都较高，因此即使是AOA的数量级高于AOB，由于AOB的基质抑制浓度较高，其氨氧化反应的主导微生物仍是AOB。正是由于AOA和AOB的这些不同特征，各种UI及NI对硝化微生物和反硝化微生物的影响也不尽相同。AOB会由于环境中氨的缺乏而无法生长，pH每降低一个单位，非质子化的氨浓度会减少一个数量级，因此AOB在酸性环境中因基质氨的缺乏而不能正常生长[23]。由于AOA与AOB的上述不同特征，使AOA和AOB存在明显的生态位分异，AOA主要在低氮及pH较低的自然生态系统中占主导作用[27]。