《表1 本项目中使用的DNA甲基化数据》
TCGA项目公布了28种癌症类型的DNA甲基化数据。原始数据(0≤x≤1)可通过TCGA官网在线获取,并映射到特定的数据位置或范围(例如,chr19:19033575指示染色体19上的位置19033575)。本文使用了由Broad Institute的FireBrowse对DNA甲基化数据进行预处理,FireBrowse[8]将数值映射到基于HGNC命名法注释的特定人类基因[9]。每个样本文件用TCGA标识符值[10]注释,该值指示样本是肿瘤组织还是正常组织(例如,TCGA-2F-A9KW-01:肿瘤类型:01~09(1类),正常类型:10~19(0类)。本文研究中选取TCGA数据库中样本数据相对较大的6种肿瘤类型统计数据见表1。
图表编号 | XD00163027000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.01 |
作者 | 刘超、吴申、郑一超、侯维岩 |
绘制单位 | 郑州大学信息工程学院、郑州大学信息工程学院、郑州大学信息工程学院、郑州大学信息工程学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |